Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms