Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms