Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms