Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID5AQ03989 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARID5AQ03989 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms