Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLTCQ00610 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms