Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms