Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms