Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms