Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms