Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A2P55011 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms