Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA2D1P54289 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms