Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIRAP54198 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIRAP54198 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HIRAP54198 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms