Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLCSP50747 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLCSP50747 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLCSP50747 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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