Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HNMTP50135 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HNMTP50135 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HNMTP50135 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HNMTP50135 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HNMTP50135 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HNMTP50135 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HNMTP50135 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HNMTP50135 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms