Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTAP49354 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms