Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCLMP48507 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCLMP48507 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCLMP48507 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms