Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms