Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBP1P32455 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GBP1P32455 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBP1P32455 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBP1P32455 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms