Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TSPOP30536 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TSPOP30536 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TSPOP30536 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TSPOP30536 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TSPOP30536 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TSPOP30536 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms