Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms