Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CNGA1P29973 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms