Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTSSP25774 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CTSSP25774 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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