Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPRZ1P23471 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1P23471 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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