Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRGP23470 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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