Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NFKB1P19838 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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NFKB1P19838 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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