Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VCLP18206 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VCLP18206 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VCLP18206 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms