Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGA4P13612 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms