Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DMDP11532 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DMDP11532 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms