Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EGFRP00533 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EGFRP00533 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms