Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TOP3BO95985 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms