Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR1AO95602 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1AO95602 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms