Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FARP2O94887 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FARP2O94887 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FARP2O94887 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms