Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)5.21□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 91.7
SF3B1O75533 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 91.7
SF3B1O75533 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.72e-6■■■■■ 91.7
SF3B1O75533 ZC3H11A-215ENST00000640465 4365 ntTSL 1 (best)4.27□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 91.7
SF3B1O75533 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 224.97■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 91.7
SF3B1O75533 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 224.97■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 91.7
SF3B1O75533 SLC25A39-210ENST00000588315 1409 ntTSL 222.05■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 91.7
SF3B1O75533 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 521.57■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 91.7
SF3B1O75533 SMG7-205ENST00000440812 1190 ntTSL 523.06■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-203ENST00000367538 328 ntTSL 220.58■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-206ENST00000444547 580 ntTSL 419.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-213ENST00000507691 760 ntTSL 519■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-204ENST00000419169 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.89■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-210ENST00000502375 566 ntTSL 516.33■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 ODF2-206ENST00000393533 2086 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 ODF2-219ENST00000546203 2140 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 ODF2-207ENST00000421776 1254 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 ADD1-211ENST00000506157 5179 ntTSL 510.4□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 REEP4-206ENST00000521744 635 ntTSL 319.31■□□□□ 0.687e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 REEP4-205ENST00000519875 732 ntTSL 318.15■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SLC22A23-206ENST00000467144 542 ntTSL 414.88□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SCAF11-209ENST00000547018 3271 ntTSL 512.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 91.6
SF3B1O75533 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.236e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)10.58□□□□□ -0.726e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)8.28□□□□□ -1.086e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.216e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.256e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)6.68□□□□□ -1.346e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.356e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)6.49□□□□□ -1.376e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.396e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)6.22□□□□□ -1.416e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.476e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.686e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 DLG1-223ENST00000471733 2605 ntTSL 1 (best)7.74□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 91.5
SF3B1O75533 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.841e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 519.79■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 516.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 PFKFB4-211ENST00000471890 553 ntTSL 415.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 414.1□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 PFKFB4-210ENST00000468162 576 ntTSL 56.27□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 EIF2D-202ENST00000367114 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 EIF2D-201ENST00000271764 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 515.86■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 GRB10-214ENST00000465602 381 ntTSL 56.41□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.017e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 91.4
SF3B1O75533 DDX11-218ENST00000542129 1561 ntTSL 217.71■□□□□ 0.436e-8■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CAST-205ENST00000348386 2272 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CTSB-222ENST00000531551 1855 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 ELF4-203ENST00000434609 406 ntTSL 315.84■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 91.3
SF3B1O75533 ZMYM2-204ENST00000382881 1912 ntTSL 225.44■■□□□ 1.664e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 CDC25B-206ENST00000467519 1960 ntTSL 1 (best)18.69■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 TBC1D9B-217ENST00000522472 668 ntTSL 514.93□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 TMEM94-232ENST00000585105 5632 ntTSL 214.43□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 91.2
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1374 ms