Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSI1O43347 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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