Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTDSP2O14595 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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