Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NFKBIEO00221 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms