Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRRT4C9JH25 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRRT4C9JH25 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms