Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms