Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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LINC00587B1AMM8 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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LINC00587B1AMM8 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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LINC00587B1AMM8 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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LINC00587B1AMM8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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LINC00587B1AMM8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00587B1AMM8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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