Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GOLGA8JA6NMD2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms