Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID3CA6NKF2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID3CA6NKF2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms