Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC162PA2VCL2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms