Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TCAF1Q9Y4C2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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