Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TTF2Q9UNY4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms