Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LAMTOR3Q9UHA4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms