Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APEX2Q9UBZ4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APEX2Q9UBZ4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms