Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
XCL2Q9UBD3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms