Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms