Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GDE1Q9NZC3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDE1Q9NZC3 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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