Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXF8

ZDHHC7, Palmitoyltransferase ZDHHC7, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC7Q9NXF8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZDHHC7Q9NXF8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZDHHC7Q9NXF8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms